从20世纪30年代至今，依据内毒素的理化性质而规划的别离、判定内毒素的技能办法主要有下述几种：

  Boivin和Messrobeanu于1935年，将活菌或经冷冻枯燥的大肠杆菌，在4℃条件下与0.25N的三氯醋酸一起振动或剧烈拌和，将细菌细胞裂解，使LPS分子从破溃的细胞外膜上游离出来。离心后取上清液经浓缩后，加2倍体积的冷冻乙醇，将生成的沉积物溶解、浓缩后冷冻枯燥，即得到LPS干粉。此法提取的LPS含有10%左右的菌体蛋白，这些蛋白质可影响LPS的理化性质和生物学活性。

  wesphal和luederitz于1952年为别离含蛋白质较低的LPS而树立的办法，今后被大范围的应用于水溶性S-LPS的提取。详细进程为：在细菌的水溶液中，参加等量90%的酚将细胞裂解，使内毒素分子从破溃的细胞外膜上游离出来。68℃，振动10～15min后，冷却、离心，搜集富含LPS的水相，并重复用水萃取3～5次，然后将水相浓缩、冷冻于燥，得到粗提的LPS，将粗制品溶解于水，高速离心（100000g，2～3h），得到颗粒状LPS后再溶于水中冷冻枯燥。此法提取的LPS纯度较高，蛋白质含量为1%~3%。

  由Galanos规划的提取R-LPS的办法。预先经乙醇、丙酮、脱脂后的枯燥菌，用90%苯酚﹑氯仿及石油醚按2∶5∶8所组成的混合提取液提取2～3次，取酚相，得到LPS和孔蛋白（porin）提取液，用减压法去除溶媒，加水构成沉积，并洗刷3～5次，然后再用80%苯酚复溶，减压枯燥，得到的LPS粗制品溶于水，超速离心取沉积，即得到LPS纯品。此法纯化得到的LPS，不含核酸和多聚糖，蛋白质含量可控制在1%以下。

  由Morrison等于1975年规划。水-丁醇法较酚法简洁，温文，适用于提取大肠杆菌和沙门菌的LPS；所得制品含蛋白量约1%。但此办法仍存在一些缺乏，因为丁醇不能灭活制品中酶类，导致在制备进程和贮存时，Lipid A常产生降解。

  运用阳离子树脂非特异性的吸顺便负电荷LPS的性质，将LPS从活动相中别离纯化出来。

  运用多粘菌素B特异性结合LPS的特性，将多粘菌素B包被于聚丙烯胺树脂等高分子聚合物的外表，制成特异性结合LPS的层析柱，即可对LPS进行亲和层析法纯化。

  通常情况下，未提纯的LPS溶液中存在许多的小分子带电物质，如Mg2+ 、Ca2+和少数的Fe2+ 、A13+、Zn2+、Na+等离子及乙醇胺、腐胺﹑精胺、亚精胺及尸胺等小分子量多胺。它们中和LPS分子上带负电荷的磷酸基团，使得本能够用带电荷的吸附剂将LPS除掉的作用显着下降。电透析就是经过离子交流的办法来进行LPS纯化的。其原理是将许多的阴/阳离子交流膜交织地串联在一起，电解质溶液则在膜间活动，两边施加直流电之后溶液中阳离子（如无机阳离子、生物碱等）向阴极移动而阴离子（如无机阴离子、有机酸等）向阳极移动。其间阴离子可顺畅经过阴离子膜，但再往前移动时却被附近的阳离子膜挡住。相同，阳离子也能够顺畅地经过阳离子膜而无法经过阴离子膜。中性化合物及高分子化合物则留在透析液中，终究得到纯化的提取物（图2-6）。

  因为提取的LPS中含有较多带正电荷的杂质，因此在LPS的电透析进程中可发现阴极的pH值升高，阳极的pH值改变不显着的现象。电透析进程中LPS溶液的pH值常有某些特定的程度的下降，一起因为有安稳LPS多聚体功用的Mg2+ 、Ca2+等离子成分被除掉，LPS多聚体变为单体而产生沉积。为防止此现象，需用NaOH或三乙胺将其间和到pH 7.0左右，使其构成中性的、高水溶性的LPS钠盐和LPS三乙胺盐而从头溶解。电透析结束时，LPS一般为酸性产品，此酸性LPS在水中的溶解度极低，可直接进行冻干处理，-4～-20℃低温保存，每次运用前可用不同的碱中和转化成所需求的LPS盐。

  依据LPS与核酸片段在分子量上的差异，可用超速离心法、电泳法等办法将其去除。